Σκοπός της Ακαδημίας, είναι η σύζευξη της σύγχρονης επιστημονικής κλασικής ιατρικής με την αρχαία ελληνική Πυθαγόρεια φιλοσοφία, η οποία σύμφωνα με την επιστημονικά τεκμηριωμένη έρευνα, αποτελεί και την σύγχρονη θεώρηση της Ιατρικής.
Η «Πυθαγόρειος Ακαδημία Επιστήμων Και Αξίων – Διεθνές Κέντρο Επιστήμης Του Στρες και Προαγωγής Της Υγείας» έχει βασική αποστολή την άοκνη συμβολή στην ανάπτυξη της έρευνας, την προώθηση της γνώσης και την εφαρμογή επιστημονικά τεκμηριωμένων προγραμμάτων στο γνωστικό πεδίο της επιστήμης του στρες και της προαγωγής της υγείας, επιδιώκοντας να συμβάλλει καθοριστικά στην προστασία και την θωράκιση των ατόμων και των κοινοτήτων απέναντι στο νοσογόνο στρες και στην βελτίωση της σωματικής, ψυχικής και κοινωνικής υγείας.